Dofinansowanie z Funduszu Spójności przeznaczane jest na duże projekty lub grupy projektów, tworzących spójną całość, których budżet jest nie mniejszy niż 10 mln euro. 

Sektor środowiska
W latach 2004-2006 do wsparcia z Funduszu Spójności kwalifikują się projekty z następujących obszarów:

• poprawa jakości wód powierzchniowych;
• polepszenie jakości i dystrybucji wody przeznaczonej do spożycia; 
• racjonalizacja gospodarki odpadami; 
• ochrona powierzchni ziemi; 
• poprawa jakości powietrza; 
• poprawa bezpieczeństwa przeciwpowodziowego.

Projekty muszą mieć znaczenie ogólnokrajowe lub ponadregionalne i przyczyniać się do redukcji zanieczyszczeń oddziałujących na znaczną liczbę ludności przy najniższych kosztach tej redukcji.

Szczegółowy opis działań znajduje się w Strategii wykorzystania Funduszu Spójności na lata 2004-2006.

Sektor transportu
Z udziałem środków z Funduszu Spójności realizowane będą inwestycje, które służą modernizacji, przebudowie i rozbudowie transeuropejskiej sieci transportowej (TEN-T). W skład sieci TEN-T wchodzą: wybrane linie kolejowe, główne drogi, drogi wodne oraz porty: morskie i lotnicze. W latach 2004-2006 realizowane będą następujące zadania:

• modernizacja wybranych linii kolejowych;
• budowa autostrad; 
• budowa dróg ekspresowych; 
• przebudowa dróg krajowych.

Sieć TEN-T: DROGI (mapa do pobrania), KOLEJE (mapa do pobrania)

Szczegółowy opis działań znajduje się w Strategii wykorzystania Funduszu Spójności na lata 2004-2006.